疾病如何在體內發生？藥物是透過哪些分子路徑發揮作用？環境中的污染物，是否正在悄悄改變我們的生理機制？面對這些高度複雜的問題，單一指標往往難以給出完整答案。臺灣師範大學化學系教授陳頌方，近年以「質譜驅動的多體學平台」作為研究室核心，展開多項研究計畫，嘗試從分子層次出發，系統性地理解疾病機制、藥物反應、食品安全或環境暴露帶來的影響。

 　　「如果只看一個蛋白質或一個代謝體，很容易忽略背後真正的機制。」陳頌方的研究取向，源自其長期累積的臨床與生物分析化學背景，無論是博士期間投入臨床分析方法開發，或後續在工研院生醫所從事生物質譜與定量蛋白質體平台建置，他逐漸體認到，許多生物醫學與環境健康議題，並非單一分子異常所致，而是多個分子層次同步改變的結果。

　　陳頌方研究室的研究可概括為四大方向：定量蛋白質體與標的蛋白質分析平台建置、代謝體分析方法學與應用、轉譯後修飾與蛋白質結構解析，以及質譜導向的生物醫學與藥物研究。團隊擅長以液相層析串聯質譜（LC-MS/MS）為核心分析工具，整合蛋白質體、代謝體與轉譯後修飾分析，藉由高靈敏度與高解析度的質譜技術，從整體分子網絡角度理解疾病、藥物反應與環境暴露對生物系統的影響。

　　其中一項具代表性的成果，是成功建立可同時進行蛋白質體與代謝體分析的整合式質譜平台，並實際應用於環境暴露與疾病模型研究。陳頌方表示，透過多體學資料整合，研究團隊觀察到粒線體能量代謝與氧化還原平衡等關鍵分子路徑出現系統性變化，這些結果往往難以透過單一分析層次察覺。

圖說：臺灣師範大學化學系教授陳頌方，近年以「質譜驅動的多體學平台」作為研究室核心，展開多項研究計畫。 

　　近年備受關注的塑膠微粒議題，也是研究室的重要研究方向之一。陳頌方說明，團隊設計動物實驗，讓老鼠攝取塑膠微粒，再分析腎臟、肝臟與腦部的蛋白質體與代謝體變化，藉此追蹤哪些生物途徑受到影響，進一步理解潛在毒性如何產生。

 　　類似的多體學分析策略，也被應用於痛風、肝再生與乳癌研究。陳頌方以乳癌研究為例，團隊與成功大學醫學院合作，比較健康對照組、罹癌個體，以及接受藥物治療後的分子變化，嘗試從分子層級理解疾病發生與治療反應的差異。

　　在生物標記研究方面，研究室也完成一項具指標性的成果—攝護腺特異抗原（PSA）異構物的精準定量分析。傳統免疫分析雖可測量 PSA 總量，卻難以區分不同結構形式的 PSA，研究團隊結合免疫沉澱、穩定同位素標定與質譜分析技術，成功在高度複雜的生物體液中，準確區分並定量不同 PSA 異構物，為攝護腺癌相關生物標記的臨床應用，提供更具鑑別力的分析工具。

 　　陳頌方強調，質譜本身只是一項分析工具，關鍵在於如何將其應用於具臨床與公共意義的問題。目前研究室的合作對象，涵蓋醫學院研究團隊、工研院，以及從事藥物開發的生技公司，期望讓分析成果能真正回到生醫與產業端。

　　然而，多體學研究並非毫無門檻。陳頌方指出，生物樣本中分子種類繁多、濃度差異極大，對樣本前處理、分析穩定度與定量準確性都是嚴峻考驗。多體學研究通常需要長時間、大量樣本分析，如何確保定量結果在不同批次間具備良好再現性，是研究團隊必須持續面對的問題。

　　另一項挑戰來自資料解析。陳頌方坦言，多體學資料量龐大，也需要高階儀器、耗材與長時間的分析流程，不僅資料解析與生物意義詮釋相當具有挑戰性，必須結合分析化學、生化背景與生物資訊分析，計畫經費的配置與使用，也必須非常謹慎。

　　展望未來，陳頌方表示，研究團隊將持續深化多體學的整合層次，並朝更高靈敏度與更具臨床可行性的分析策略發展。同時，也希望能與臨床研究、藥物流行病學或真實世界資料分析接軌，讓質譜多體學不只是「看得到分子變化」，而是能將這些分析方法平台化、標準化，讓質譜成為更多研究與應用場域中的可靠工具。

(採訪撰文 | 由本校公共事務中心提供)。